DNA software社
DNA software社(DNAS)は、お客様の『比類ない感度・特異性を備えた診断アッセイや治療法の開発』の一助となるテクノロジーのポートフォリオを提供しています。
DNA software社製品概要
OMP-DE™
DNA Softwareの製品の中核を担うプログラム可能なモデリング環境です。
ローカルサーバーの計算およびストレージ容量にアクセスする顧客固有のアプリケーションの開発に使用されます。
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Visual OMP™
Visual OMP™は特定の実験条件に最適化された、プライマーおよびプローブのセットをデザインするためのソフトウェアです。
実験環境の詳細を入力するだけで、何千もの可能性のある組み合わせについてシミュレーションを行い、最も特異性が高く感度が良いオリゴヌクレオチドのセットを同定します。
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PanelPlex-Consensus(DNAS Designer)
クラウドアプリケーション向けのオリゴデザインエンジンです。DNA Softwareが開発した独自のアルゴリズムは、生成する候補プローブとプライマーのフォールディングやその他の特性を正確に予測します。
その予測に従って、各用途に最適な候補をランク付け・選択できます。それにより、ターゲットの二次構造内の設計に最適な場所が明らかになるため、ニーズに最適な感度と特異性をもつプローブとプライマーを選択可能です。
主な対象:細菌、ウイルス、ヒトゲノム標的、mRNAプロファイリングのための感染症変異体、PanelPlexの異なるバリアント
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PanelPlex™(DNAS Simulator)
クラウドアプリケーション用のPCR実験シミュレーションエンジンです。DNA Softwareが開発した独自のフォールディングアルゴリズムは、実験条件下でのオリゴプライマーとターゲット配列間の動作と相互作用を正確に予測します。したがって、不要な二次構造やオリゴ間の混成化など望ましくない結果の予測・回避が可能であり、結果的に最適なソリューションを選択できます。
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Oligo Kinetics Simulator™
OligoKS Kinetics Simulator: OligoKS ™は、シーケンスから速度動態を予測し、オリゴヌクレオチドのハイブリダイゼーションの動態と競合する単分子フォールディングの理解に対する画期的なソフトウェアです。高速サイクリングPCRやマイクロアレイプローブのハイブリダイゼーション等のアッセイフォーマットに重要です。
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ThermoBLAST ™
無償ソフトウェアBLASTの機能を備えつつ、欠点(バックボーンが考慮されない、実際の条件下でシミュレーションできないなど)を改善したソフトウェアです。
ゲノム全体をスキャンして、偽陽性のハイブリダイゼーションとアンプリコンをすべて検出することで、アッセイの特異性を向上させます。
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ThermoBLAST Cloud Edition (TB-CE)
ThermoBLAST Cloud Edition(TB-CE)は商用にリリースされたThermoBLAST™です。
クラウドベースであるため処理速度が向上しております。また、個人アカウントに過去の結果をアーカイブすることも可能です。
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CopyCount
標準曲線を必要とせず、かつ機器を変更することもなく、すべてのqPCR反応を絶対定量に変換します。CopyCountは、試薬のコスト、複製回数、手間のかかる標準曲線の作成らすべてを削減することにより、費用と時間を節約します。
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DNA software社の手法
DNASは、アルゴリズムルールまたは戦略の形で専門知識を収集し、最適なソリューションを効果的に識別・フィルタリングしています。
DNA software社のセキュリティ
DNA Software Application Portalは、Amazon Web Services(AWS)Elastic Compute Cloud(EC2)サービスを利用しており、任意のコンピューター、タブレット、モバイルデバイスからアクセスできます。
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