siTOOLs社のriboPOOLの紹介ページです。
効率的かつ安価にあらゆる種のリボソームRNAを除去
次世代RNA配列決定(RNAシーケンス)を用いる際に、読み取った領域の90%以上がリボソームRNA(rRNA)であり、科学的に意味のあるRNAのNGSによる高感度分析うまくいかないことが問題となっています。その対策用の既存のキットは高価である上、対象は分析対象となることが多い生物種に限られています。
siTOOLs Biotech社のリボソームRNA除去プール(riboPOOL™)は安価かつ高性能なRNA除去試薬であり、あらゆる生物種のrRNAやmRNA等、他の種類のRNAの除去に利用可能です。
riboPOOL™は最適化された配列を持つ多数のビオチン化DNAで構成されるDNAプールであり、Ribo-Zero(Illumina社）と比較して10％以上多くrRNAを除去することが可能であり、その他のRNAには影響を与えません。
Pan-Prokaryote riboPOOL™は、広範囲の微生物に対して普遍的にrRNAを除去するため、メタゲノムまたはマイクロバイオーム試料に適しています。複数の生物種を含むサンプルからrRNAを除去するために、riboPOOL™を組み合わせることも可能です。
種に依存しない優れた除去性能
ヒトriboPOOL™を用いた実験では、競合製品の80.6%と比較して各段に優れた98.6%の除去率を記録しました。
マウスriboPOOL™を用いた実験でも、競合製品では86.1%、riboPOOL™では96.4%の除去率を記録しました。
高い再現性
ヒトriboPOOL™を用いた独立した実験間での高い再現性
マウスriboPOOL™を用いた独立した実験間での高い再現性
Hela細胞およびマウス胚線維芽細胞から全RNA（1μg)が単離され、riboPOOL™またはRiboZero(Illumina社)を用いrRNAの除去処理が行われました。RNAインテグリティはAgilent 2100 Bioanalyzerを用いて算出され、品質基準(RIN値が7.5以上）を満たしていることを確認後Illumina社TruSeqStranded Total RNA技術を利用してライブラリの調製が行われました。シークエンシングはIllumina社NextSeq 500を用い、1×75 bp signle read chemistryを採用した高アウトプットモードで実施され、十分量の高品質なリードが得られました。RNA-SeqはCLC Genomics workbenchを用いて実施されました。
製品情報
・HPLCで精製、室温で凍結乾燥して出荷
・全てのリボソームRNA（細胞質＋ミトコンドリア）に対する、効率的かつ特異的な除去
・全ての生物種に有効：ヒト、マウス、プラナリア、ショウジョウバエ、カイコ等はストックあり。カスタムでその他の種も提供
・既製のriboPOOL™は多様な種に利用可能
既製のriboPOOL対象種リスト
| ＊対象の真核生物 | ＊対象の原核生物 |
| Homo sapiens(ヒト) | 汎原核生物(普遍微生物) |
| Mus musculus/Rattus norvegicus(マウス/ラット) | 汎原核生物v2(普遍微生物) |
| Drosophila melanogaster(キイロショウジョウバエ) | 汎細菌 |
| Arabidopsis thaliana (植物) | 汎放線菌 |
| Danio rerio(ゼブラフィッシュ) | 汎古細菌 |
| Sacchromyces cerevisiae (酵母) | 大腸菌 |
| Pichia pastoris(酵母) | 緑膿菌 |
| Bombyx morii (カイコガ) | 黄色ブドウ球菌 |
| Ustilago maydis(細菌) | 枯草菌 |
| Amphimedon queenslandica(海綿) | サルモネラ菌 |
| Schmidtea mediterranea(プラナリア) | ステノトロフォモナス属 |
| Plautia stali (チャバネアオカメムシ) | Caulobacter crescentus |
| Chinchilla Laginera(チンチラ) | Haloferax volcanii |
| Oryza sativa (米) | ＊その他のRNA |
| Loripes orbiculatus+Lucinoma aequizonata(アサリ) | ヒト グロビン (mRNA) |
・安価な提供価格
＊新種のカスタムriboPOOL™は、初回のみカスタムriboPOOL™セットアップサービス費用が掛かります
・rRNA以外でも、ターゲットとするRNAの除去が可能（例：全血中のグロビンmRNA)
・ポリアデニル化/非ポリアデニル化（例：lncRNA)の両方のRNAに利用可能
・ご要望のスケールでお届け
・柔軟性を高めるために、複数の種にわたる試料に使用できるriboPOOL™をカスタム比率で組み合わせた、コンビネーションriboPOOL™をご利用頂けます
使用可能なriboPOOL™のフォーマット
・riboPOOL™キット
ライブラリー調製までのすべての試薬
マニュアル付き
反応サイズ:12、24、96
＊初回購入時限定で6反応試験キットもご用意しております。お問い合わせください
・riboPOOL™プローブ
リボーPOOLプローブ、無核水のセット
プロトコルはダウンロード可能
反応サイズ:20(2nmol)、50(5nmol)、100(10nmol)
riboPOOL™製品リスト
| カタログ番号 | 製品名 | 製品詳細 | 容量 | 価格と納期 |
| rdS00501 | riboPOOLサンプル 0.5 nmol | カタログ/カスタム*riboPOOL | 0.5 nmol | お問い合わせください |
| rdS02001 | riboPOOL 2 nmol | カタログ/カスタム*riboPOOL | 2 nmol | お問い合わせください |
| rdS05001 | riboPOOL 5 nmol | カタログ/カスタム*riboPOOL | 5 nmol | お問い合わせください |
| rdS10001 | riboPOOL 10 nmol | カタログ/カスタム*riboPOOL | 10 nmol | お問い合わせください |
| rdS02002 | riboPOOLコンビネーション 2 nmol | 2種類以上のriboPOOL合計2 nmol | 2 nmol | お問い合わせください |
| rdS05002 | riboPOOLコンビネーション 5 nmol | 2種類以上のriboPOOL合計5 nmol | 5 nmol | お問い合わせください |
| rdS10002 | riboPOOLコンビネーション 10 nmol | 2種類以上のriboPOOL合計10 nmol | 10 nmol | お問い合わせください |
| rdSKH1201 | riboPOOLヒト・マウス/ラットキット 12 reactions | 2種類以上のriboPOOL合計11 nmol | 12 reactions | お問い合わせください |
| rdSKH2401 | riboPOOLヒト・マウス/ラットキット 24 reactions | 2種類以上のriboPOOL合計12 nmol | 24 reactions | お問い合わせください |
| rdSKH9601 | riboPOOLヒト・マウス/ラットキット 96 reactions | 2種類以上のriboPOOL合計13 nmol | 96 reactions | お問い合わせください |
| rdSKH1210 | riboPOOLヒト・マウス/ラットキット バルク10 12 reactions | 2種類以上のriboPOOL合計14 nmol | 12 reactions | お問い合わせください |
| rdSKH2410 | riboPOOLヒト・マウス/ラットキット バルク10 24 reactions | 2種類以上のriboPOOL合計15 nmol | 24 reactions | お問い合わせください |
| rdSKH9610 | riboPOOLヒト・マウス/ラットキット バルク10 96 reactions | 2種類以上のriboPOOL合計16 nmol | 96 reactions | お問い合わせください |
| rdSKH1230 | riboPOOLヒト・マウス/ラットキット バルク30 12 reactions | 2種類以上のriboPOOL合計17 nmol | 12 reactions | お問い合わせください |
| rdSKH2430 | riboPOOLヒト・マウス/ラットキット バルク30 24 reactions | 2種類以上のriboPOOL合計18 nmol | 24 reactions | お問い合わせください |
| rdSKH9630 | riboPOOLヒト・マウス/ラットキット バルク30 96 reactions | 2種類以上のriboPOOL合計19 nmol | 96 reactions | お問い合わせください |
| rdSKO1201 | riboPOOLキット 12 reactions | 2種類以上のriboPOOL合計20 nmol | 12 reactions | お問い合わせください |
| rdSKO2401 | riboPOOLキット 24 reactions | 2種類以上のriboPOOL合計21 nmol | 24 reactions | お問い合わせください |
| rdSKO9601 | riboPOOLキット 96 reactions | 2種類以上のriboPOOL合計22 nmol | 96 reactions | お問い合わせください |
| rdSKO1210 | riboPOOLキット バルク10 12 reactions | 2種類以上のriboPOOL合計23 nmol | 12 reactions | お問い合わせください |
| rdSKO2410 | riboPOOLキット バルク10 24 reactions | 2種類以上のriboPOOL合計24 nmol | 24 reactions | お問い合わせください |
| rdSKO9610 | riboPOOLキット バルク10 96 reactions | 2種類以上のriboPOOL合計25 nmol | 96 reactions | お問い合わせください |
| rdSKO1230 | riboPOOLキット バルク30 12 reactions | 2種類以上のriboPOOL合計26 nmol | 12 reactions | お問い合わせください |
| rdSKO2430 | riboPOOLキット バルク30 24 reactions | 2種類以上のriboPOOL合計27 nmol | 24 reactions | お問い合わせください |
| rdSKO9630 | riboPOOLキット バルク30 96 reactions | 2種類以上のriboPOOL合計28 nmol | 96 reactions | お問い合わせください |
| rdSKC1201 | riboPOOLキットコンビネーション 12 reactions | 2種類以上のriboPOOL合計29 nmol | 12 reactions | お問い合わせください |
| rdSKC2401 | riboPOOLキットコンビネーション 24 reactions | 2種類以上のriboPOOL合計30 nmol | 24 reactions | お問い合わせください |
| rdSKC9601 | riboPOOLキットコンビネーション 96 reactions | 2種類以上のriboPOOL合計31 nmol | 96 reactions | お問い合わせください |
| rdSKC1210 | riboPOOLキットコンビネーション バルク10 12 reactions | 2種類以上のriboPOOL合計32 nmol | 12 reactions | お問い合わせください |
| rdSKC2410 | riboPOOLキットコンビネーション バルク10 24 reactions | 2種類以上のriboPOOL合計33 nmol | 24 reactions | お問い合わせください |
| rdSKC9610 | riboPOOLキットコンビネーション バルク10 96 reactions | 2種類以上のriboPOOL合計34 nmol | 96 reactions | お問い合わせください |
| rdSKC1230 | riboPOOLキットコンビネーション バルク30 12 reactions | 2種類以上のriboPOOL合計35 nmol | 12 reactions | お問い合わせください |
| rdSKC2430 | riboPOOLキットコンビネーション バルク30 24 reactions | 2種類以上のriboPOOL合計36 nmol | 24 reactions | お問い合わせください |
| rdSKC9630 | riboPOOLキットコンビネーション バルク30 96 reactions | 2種類以上のriboPOOL合計37 nmol | 96 reactions | お問い合わせください |
*カスタムriboPOOL™セットアップ費用は初回のみ本体価格に加算されます