siTOOLs社のriboPOOLの紹介ページです。

効率的かつ安価にあらゆる種のリボソームRNAを除去

次世代RNA配列決定(RNAシーケンス)を用いる際に、読み取った領域の90%以上がリボソームRNA(rRNA)であり、科学的に意味のあるRNAのNGSによる高感度分析うまくいかないことが問題となっています。その対策用の既存のキットは高価である上、対象は分析対象となることが多い生物種に限られています。

siTOOLs Biotech社のリボソームRNA除去プール(riboPOOL™)は安価かつ高性能なRNA除去試薬であり、あらゆる生物種のrRNAやmRNA等、他の種類のRNAの除去に利用可能です。
riboPOOL™は最適化された配列を持つ多数のビオチン化DNAで構成されるDNAプールであり、Ribo-Zero(Illumina社)と比較して10%以上多くrRNAを除去することが可能であり、その他のRNAには影響を与えません。

Pan-Prokaryote riboPOOL™は、広範囲の微生物に対して普遍的にrRNAを除去するため、メタゲノムまたはマイクロバイオーム試料に適しています。複数の生物種を含むサンプルからrRNAを除去するために、riboPOOL™を組み合わせることも可能です。

種に依存しない優れた除去性能

ヒトriboPOOL™を用いた実験では、競合製品の80.6%と比較して各段に優れた98.6%の除去率を記録しました。

マウスriboPOOL™を用いた実験でも、競合製品では86.1%、riboPOOL™では96.4%の除去率を記録しました。

高い再現性

ヒトriboPOOL™を用いた独立した実験間での高い再現性

マウスriboPOOL™を用いた独立した実験間での高い再現性

Hela細胞およびマウス胚線維芽細胞から全RNA(1μg)が単離され、riboPOOL™またはRiboZero(Illumina社)を用いrRNAの除去処理が行われました。RNAインテグリティはAgilent 2100 Bioanalyzerを用いて算出され、品質基準(RIN値が7.5以上)を満たしていることを確認後Illumina社TruSeqStranded Total RNA技術を利用してライブラリの調製が行われました。シークエンシングはIllumina社NextSeq 500を用い、1×75 bp signle read chemistryを採用した高アウトプットモードで実施され、十分量の高品質なリードが得られました。RNA-SeqはCLC Genomics workbenchを用いて実施されました。

製品情報

・HPLCで精製、室温で凍結乾燥して出荷
・全てのリボソームRNA(細胞質+ミトコンドリア)に対する、効率的かつ特異的な除去
・全ての生物種に有効:ヒト、マウス、プラナリア、ショウジョウバエ、カイコ等はストックあり。カスタムでその他の種も提供
・既製のriboPOOL™は多様な種に利用可能

既製のriboPOOL対象種リスト

*対象の真核生物 *対象の原核生物
Homo sapiens(ヒト) 汎原核生物(普遍微生物)
Mus musculus/Rattus norvegicus(マウス/ラット) 汎原核生物v2(普遍微生物)
Drosophila melanogaster(キイロショウジョウバエ) 汎細菌
Arabidopsis thaliana (植物) 汎放線菌
Danio rerio(ゼブラフィッシュ) 汎古細菌
Sacchromyces cerevisiae (酵母) 大腸菌
Pichia pastoris(酵母) 緑膿菌
Bombyx morii (カイコガ) 黄色ブドウ球菌
Ustilago maydis(細菌) 枯草菌
Amphimedon queenslandica(海綿) サルモネラ菌
Schmidtea mediterranea(プラナリア) ステノトロフォモナス属
Plautia stali (チャバネアオカメムシ) Caulobacter crescentus
Chinchilla Laginera(チンチラ) Haloferax volcanii
Oryza sativa (米) *その他のRNA
Loripes orbiculatus+Lucinoma aequizonata(アサリ) ヒト グロビン (mRNA)

・安価な提供価格
*新種のカスタムriboPOOL™は、初回のみカスタムriboPOOL™セットアップサービス費用が掛かります
・rRNA以外でも、ターゲットとするRNAの除去が可能(例:全血中のグロビンmRNA)
・ポリアデニル化/非ポリアデニル化(例:lncRNA)の両方のRNAに利用可能
・ご要望のスケールでお届け
・柔軟性を高めるために、複数の種にわたる試料に使用できるriboPOOL™をカスタム比率で組み合わせた、コンビネーションriboPOOL™をご利用頂けます

*汎原核生物用riboPOOLの詳細はこちら

使用可能なriboPOOL™のフォーマット

・riboPOOL™キット
ライブラリー調製までのすべての試薬
マニュアル付き
反応サイズ:12、24、96
*初回購入時限定で6反応試験キットもご用意しております。お問い合わせください
・riboPOOL™プローブ
リボーPOOLプローブ、無核水のセット
プロトコルはダウンロード可能
反応サイズ:20(2nmol)、50(5nmol)、100(10nmol)

riboPOOL™製品リスト

カタログ番号 製品名 製品詳細 容量 価格と納期
rdS00501 riboPOOLサンプル 0.5 nmol カタログ/カスタム*riboPOOL 0.5 nmol お問い合わせください
rdS02001 riboPOOL 2 nmol カタログ/カスタム*riboPOOL 2 nmol お問い合わせください
rdS05001 riboPOOL 5 nmol カタログ/カスタム*riboPOOL 5 nmol お問い合わせください
rdS10001 riboPOOL 10 nmol カタログ/カスタム*riboPOOL 10 nmol お問い合わせください
rdS02002 riboPOOLコンビネーション 2 nmol 2種類以上のriboPOOL合計2 nmol 2 nmol お問い合わせください
rdS05002 riboPOOLコンビネーション 5 nmol 2種類以上のriboPOOL合計5 nmol 5 nmol お問い合わせください
rdS10002 riboPOOLコンビネーション 10 nmol 2種類以上のriboPOOL合計10 nmol 10 nmol お問い合わせください
rdSKH1201 riboPOOLヒト・マウス/ラットキット 12 reactions 2種類以上のriboPOOL合計11 nmol 12 reactions お問い合わせください
rdSKH2401 riboPOOLヒト・マウス/ラットキット 24 reactions 2種類以上のriboPOOL合計12 nmol 24 reactions お問い合わせください
rdSKH9601 riboPOOLヒト・マウス/ラットキット 96 reactions 2種類以上のriboPOOL合計13 nmol 96 reactions お問い合わせください
rdSKH1210 riboPOOLヒト・マウス/ラットキット バルク10 12 reactions 2種類以上のriboPOOL合計14 nmol 12 reactions お問い合わせください
rdSKH2410 riboPOOLヒト・マウス/ラットキット バルク10 24 reactions 2種類以上のriboPOOL合計15 nmol 24 reactions お問い合わせください
rdSKH9610 riboPOOLヒト・マウス/ラットキット バルク10 96 reactions 2種類以上のriboPOOL合計16 nmol 96 reactions お問い合わせください
rdSKH1230 riboPOOLヒト・マウス/ラットキット バルク30 12 reactions 2種類以上のriboPOOL合計17 nmol 12 reactions お問い合わせください
rdSKH2430 riboPOOLヒト・マウス/ラットキット バルク30 24 reactions 2種類以上のriboPOOL合計18 nmol 24 reactions お問い合わせください
rdSKH9630 riboPOOLヒト・マウス/ラットキット バルク30 96 reactions 2種類以上のriboPOOL合計19 nmol 96 reactions お問い合わせください
rdSKO1201 riboPOOLキット 12 reactions 2種類以上のriboPOOL合計20 nmol 12 reactions お問い合わせください
rdSKO2401 riboPOOLキット 24 reactions 2種類以上のriboPOOL合計21 nmol 24 reactions お問い合わせください
rdSKO9601 riboPOOLキット 96 reactions 2種類以上のriboPOOL合計22 nmol 96 reactions お問い合わせください
rdSKO1210 riboPOOLキット バルク10 12 reactions 2種類以上のriboPOOL合計23 nmol 12 reactions お問い合わせください
rdSKO2410 riboPOOLキット バルク10 24 reactions 2種類以上のriboPOOL合計24 nmol 24 reactions お問い合わせください
rdSKO9610 riboPOOLキット バルク10 96 reactions 2種類以上のriboPOOL合計25 nmol 96 reactions お問い合わせください
rdSKO1230 riboPOOLキット バルク30 12 reactions 2種類以上のriboPOOL合計26 nmol 12 reactions お問い合わせください
rdSKO2430 riboPOOLキット バルク30 24 reactions 2種類以上のriboPOOL合計27 nmol 24 reactions お問い合わせください
rdSKO9630 riboPOOLキット バルク30 96 reactions 2種類以上のriboPOOL合計28 nmol 96 reactions お問い合わせください
rdSKC1201 riboPOOLキットコンビネーション 12 reactions 2種類以上のriboPOOL合計29 nmol 12 reactions お問い合わせください
rdSKC2401 riboPOOLキットコンビネーション 24 reactions 2種類以上のriboPOOL合計30 nmol 24 reactions お問い合わせください
rdSKC9601 riboPOOLキットコンビネーション 96 reactions 2種類以上のriboPOOL合計31 nmol 96 reactions お問い合わせください
rdSKC1210 riboPOOLキットコンビネーション バルク10 12 reactions 2種類以上のriboPOOL合計32 nmol 12 reactions お問い合わせください
rdSKC2410 riboPOOLキットコンビネーション バルク10 24 reactions 2種類以上のriboPOOL合計33 nmol 24 reactions お問い合わせください
rdSKC9610 riboPOOLキットコンビネーション バルク10 96 reactions 2種類以上のriboPOOL合計34 nmol 96 reactions お問い合わせください
rdSKC1230 riboPOOLキットコンビネーション バルク30 12 reactions 2種類以上のriboPOOL合計35 nmol 12 reactions お問い合わせください
rdSKC2430 riboPOOLキットコンビネーション バルク30 24 reactions 2種類以上のriboPOOL合計36 nmol 24 reactions お問い合わせください
rdSKC9630 riboPOOLキットコンビネーション バルク30 96 reactions 2種類以上のriboPOOL合計37 nmol 96 reactions お問い合わせください

*カスタムriboPOOL™セットアップ費用は初回のみ本体価格に加算されます